大家都知道大肠杆菌是常在菌，只要生活在适宜的环境里就可以大量繁殖，墙脚、鸡笼、料槽、饮水器、蛋槽等等，都有可能隐藏着大量的大肠杆菌，就有可能威胁到鸡群的健康。蛋鸡舍受蛋鸡的饲养周期影响，至少一年半甚至是两年才能彻底清理一次，所以舍内的细菌、病毒等病原体的“存栏量”会远远高出鸡的存栏量，因此在高温的夏季里，消毒是必不可少的重要环节，比如饮水消毒、喷雾消毒、清洗消毒等，必要时在高温来临之前做一次熏蒸消毒。
　　消毒预防
　　一要广谱、高效、无毒、无残留；二要品种齐全，效果确实；三要根据消毒方法以及消毒对象选择消毒液；四要性质稳定，遇水、氧气、酸、碱，不降低消毒效力，不释放毒等；五要交替使用，不能多种 混合或长期使用一种消毒液。
　　药物预防
　　提起药物预防，人们第一直觉就会想到，不就是使用头孢噻呋、氟苯尼考、氧氟沙星、环丙沙星、强力霉素等药物饮水吗？或者说是使用一些中草药拌料。以上这些药物的作用都是直接杀灭大肠杆菌，属于攻击的方法。除了这些还有一些强壮自我的自卫式预防措施，比如给鸡群饲喂一些黄芪、党参、板蓝根、白头翁、山楂、陈皮、麦芽、免疫球蛋白、聚肌胞等，增强机体自身的免疫力以及胃肠的功能，不给病原侵入的缝隙。