治疗肠道疾病应遵循的原则有消除致病因素、排除内毒素保护肝肾、补充电解质和维生素、调节肠道内环境、消灭病原体及修复受损的肠道粘膜避免重复感染。
   
　　消除致病因素
    
　　主要是饲料因素和应激因素。如果不去贪图眼前的小利，饲料因素应该是可控的。消除应激因素，适时投喂电解多维、鱼肝油和维生素C等是有必要的。
   
　　排除内毒素，保护肝肾
   
　　一般的说中药较为适宜，比如清热解毒类中药等。
  
　　补充电解质和维生素
   
　　出现肠道疾病要标本兼治，不可有病乱投药。肠道疾病腹泻症状为标，致病因素即病原为本，不可只为止泻而忽略了对病原的消除；只为抗菌而忽略了对肠道毒素的排除和粘膜的保护；补充电解质和维生素，调节腹泻造成的体内电解质失调和酸碱平衡紊乱。只有采取积极的预防手段和标本兼治的原则，才可能最大的降低肠道疾病对肉鸡的危害。
  
　　调节肠道内环境
   
　　抑制厌氧菌的生长，保护肠道有益菌，维持肠道的正常pH值。常用的药物有甲硝唑、替硝唑和一些中药。
  
　　消灭病原体
   
　　主要包括细菌、病毒和寄生虫。以病原对药物的敏感程度，可选用喹诺酮类、多粘菌素类、氨基糖甙类等药物。
  
    修复受损的肠道粘膜，避免重复感染
   
　　常规用药是补充鱼肝油（维生素A）。因为维生素A可以维持粘膜上皮细胞的完整性、修复被损粘膜，从而防治腹泻的复发。