空舍整理的目的是彻底清理鸡舍卫生，减少鸡粪、羽毛、残料的残留，降低舍内病原微生物数量，完全阻断上批次与下批次间的疾病传播，为下一批鸡的健康成长奠定基础。因此在鸡舍整理中重点是对饲料、鸡粪、羽毛这些容易被病原微生物利用的感染源进行清理。
   
　　一、饲料清理
   
　　在淘鸡前几天要时刻留意料塔中的余料，防止料槽和料塔中积料，淘鸡后首先应把料塔、料线、料槽里面的积料清扫干净，再用钢丝球把料槽擦一遍，以清除长期积累的油渍和粉尘，然后用刷子把料槽扫干净。料槽除了清除内底部、内壁的积料之外还要清除外部和外底部的积料。机头、机尾还有料车顶部由于采用菱角的设计，导致死角较多，此外料车的轨道与料槽之间的缝隙也是藏污纳垢的地方，都应当仔细清扫。
   
　　二、鸡粪清理
   
　　铲粪包括地沟的底壁和侧壁、粪板、蛋网底部、鸡笼大架内壁和外壁。
   
　　首先铲粪板上的粪，俩人一组配合，铲完粪板上的粪要及时刮出，防止大绳拉断，然后再铲地沟，地沟的粪要铲干净，同时把蛋网底部铲干净，顺带着用钢丝球把大架擦干净，去掉粪渍和结晶碱。
   
　　要特别注意有些粪板两面都有粪便，而且有些粪便很硬如果不铲除彻底，最后用水冲洗会使粪便松散，在水流的冲击下到处喷溅，给其它的粪板造成二次污染。粪便在这些经过地方日积月累，就会粘在金属的表面形成一层硬膜，如果仅用抹布、毛巾擦拭，都会无济于事，必须使用清洁球蹭掉，最佳的擦拭效果是使上面的硬膜脱落形成粉末，露出金属原有的光泽，便于最后的冲洗。
   
　　三、鸡毛清理
   
　　笼架上残余的鸡毛常常被我们忽视，总是认为稍借助于外力即可弄掉，而实际上这种观点是错误的。羽毛的密度大于空气，可以飘散，但是遇水以后就会牢牢地粘在笼子上，任凭水枪怎么冲，它都安然无恙，最佳的方法就是在冲洗笼架之前好好的把羽毛摘干净，特别是支架和笼具之间的部分往往会遮住视线，这里的羽毛更需要摘下来，以免影响冲洗效果。