在鸡群转入之前，必须对鸡舍及其设备进行彻底清洗和消毒。对供水、供电、通风、鸡舍防雨、鸡舍保温设施、鼠洞、门窗玻璃等及时检查维修。消毒程序如下：
   
    1.喷洒消毒：已养过鸡舍，在上批鸡淘汰后，在打扫和清理之前要先进行预备消毒。用普通消毒剂对鸡舍内进行喷雾消毒，使鸡舍内环境湿润，以防清扫时尘埃飞扬。
   
    2.清理物资：移出用具，拆掉棚架，并将产蛋箱、饮水、供料（机械供料除外）、清粪用具等搬出舍外指定地点进行冲刷、晾晒、消毒。
   
    3.鸡舍清扫：先清理舍内鸡粪，然后再彻底清扫鸡舍，包括顶棚、死角、鸡笼、鸡架、鸡舍四壁、地面等。
   
    4.冲洗：将清扫完毕的鸡舍用高压水枪对顶棚、死角、墙壁、鸡笼鸡网架、地面等进行彻底冲刷，使鸡舍内不得存有灰尘、蜘蛛网等。鸡笼、鸡网架的底面不得残存鸡粪，使舍内真正达到清洁。
   
    5.火焰消毒：用火焰喷灯或其他火具将舍内所有表面喷烧一遍（对于塑料或木制器具应注意防火和保护），以达到表面灭菌的目的。
   
    6.设备复位：将移出后清洗和消毒过的料桶、料槽、饮水器等用具重新搬至舍内，并安装调试正常。地面平养时铺好垫料。
   
    7.喷洒消毒：当舍内温度达到25摄氏度以上、相对湿度60%以上时，封闭好门窗和通风孔，用烈性消毒药品喷雾消毒。可选用2～3%的火碱水（对金属制品禁用）、甲醛（用水1：1稀释后直接喷洒）、10%的石灰水等。喷洒的程序是地面→顶棚→墙壁→鸡笼（或棚架）及设备→地面。喷洒消毒必须坚持消毒→干燥鸡舍→再消毒→再干燥的步骤，以保证效果。
   
    8.熏蒸消毒：上述步骤完成后，将鸡舍门窗、通风孔封闭，使舍内温度升至25摄氏度以上，相对湿度60%以上，用甲醛和高锰酸钾（每立方米空间用42ml甲醛，21g高锰酸钾）熏蒸24h，待进鸡前三天打开门窗散发气味尽。清理空舍时间应不低于三周。