胚胎早期（1～7天）死亡此期的胚胎死亡主要与遗传、种鸡的健康状况、贮存及孵化条件等有关。种蛋受精率与早期死胎率也有关联，受精率越低，早期死胎率愈高。
   
    ①孵化厅内造成胚胎早期死亡的原因有：贮蛋条件不正常（一般要求种蛋在16～17℃环境中贮存不超过7天）、消毒不当（如熏蒸剂量不正确，在入孵后第4～96小时期间熏蒸）、蛋盘设计不合理（如蛋盘间距过小）而造成种蛋破损，或因翻蛋系统故障而造成的长时间不翻蛋或翻蛋角度不正常，孵化器温度过高或波动太大。
   
    ②孵化厅外造成胚胎早期死亡的原因有：种蛋在鸡舍受到污染（如窝外蛋），因产蛋箱设计不合理或操作不当而造成蛋破裂，收蛋不及时或鸡抱窝造成种蛋在贮存之前已经开始发育，蛋壳质量差，饲料中添加某些药物（如球虫净）或用药方法不当，营养问题（如缺乏维生素A、维生素E、生物素等），种鸡感染新城疫、传染性支气管炎等疾病，种蛋受精率低，来源于饲料、饮水等渠道的毒素太多等。
   
    胚胎中期（8～14天）死亡此期种蛋孵化的死胎率一般较低，如果孵化器通风不良或孵化温度、湿度及翻蛋不当则能造成此期死胎率偏高。遗传及营养已不再是中期死亡的主要原因。
   
    胚胎后期（15～21天）此期胚胎死亡主要与种蛋的贮存、运输、孵化条件、蛋壳质量等因素有关。
   
    ①孵化厅内造成胚胎前期死亡的原因有：种蛋入孵前贮存期过长、贮存温度不适宜，孵化温度、湿度不当，孵化器或孵化室通风不良，小头向上孵化，孵化头2周翻蛋不正常，落盘时蛋破裂等。
   
    ②孵化厅内造成胚胎后期死亡的原因有：新城疫、传染性支气管炎、鸡白痢等疾病，蛋壳质量差，营养问题如缺乏锰、生物素、维生素B12等。