1、急性小肠球虫病  本病多见于30日龄以上鸡及初产鸡，由毒害艾美耳球虫损害小肠中段，使小肠缩短、变粗、臌气，同时整个小肠黏膜呈粉红色。在裂殖体繁殖的部位，有明显的淡白色斑点，黏膜上有许多小出血点。肠管中有凝固的血液或有葫萝卜色胶冻状的内容物。病鸡排出的粪便带血色、稍暗，并伴有多量粘液。由于受损的是小肠，对消化吸收机能影响很大，并易继发细菌和病毒感染。急性小肠球虫病的死亡率比急性盲肠球虫病低一些，但病鸡康复缓慢，并常遗留一些失去生产价值的弱鸡。

    2、急性盲肠球虫病   由柔嫩艾美耳球虫引起，雏鸡易感，是雏鸡和低龄青年鸡最常见的球虫病，主要侵害盲肠，两支盲肠显著肿大，可为正常的3~5倍，肠腔中充满凝固或新鲜的暗红色血液，盲肠上皮变厚，有严重的糜烂。病鸡表现为精神呆滞，缩头闭眼打盹，很少采食，病鸡排出带有鲜血的粪便。

    3、慢性球虫病  巨型艾美耳球虫损害小肠中段，可使肠管扩张、肠壁增厚，内容物粘稠，呈淡灰色、淡褐色或淡红色。堆型艾美耳球虫多在上皮表层发育，并且同一发育阶段的虫体常聚集在一起，在被损害的肠段出现大量淡白色斑点。