发病初期病鸡精神沉郁，采食减少，排水样稀粪;严重者排深褐色和西红柿样粪便，有刺鼻难闻的气味，粪便中含有血液和黏液，出现零星死亡。3天以后，病鸡不愿走动，尖叫，夜间死亡明显增多，最高一昼夜死亡25只；部分病鸡死前精神、采食基本正常，突然死亡。
   
    解剖病死鸡，主要病理变化如下：小肠特别是中段肠管扩张肿胀充满气体，肠壁增厚；有的肠道呈明显的结节状。从浆膜面看，在感染部位可看到白色针尖大小的病灶，有的为片状出血斑;肠内容物呈淡灰色、褐色或红色，有的肠内有水样稀粪，肠壁黏膜呈麸皮样；空肠和回肠变脆，充满气体，肠黏膜覆盖一层黄色或绿色伪膜，黏膜有出血斑点。

    肠黏膜涂片检查 从病死鸡的小肠中段病变部位刮取肠黏膜涂片，用生理盐水稀释，加盖玻片镜检，可看到成簇的大型裂殖体。综合临床症状、病理解剖和实验室检查，诊断为毒害艾美耳球虫并发细菌引起的坏死性肠炎。