肉鸡球虫病主要是鸡食入了被球虫卵囊污染的饲料、饮水后，卵囊被胃内消化液溶解，子孢子游离出来寄生在鸡的肠道上皮细胞内进行裂殖生殖时引起肠管反应和大量上皮细胞崩解，以致使肠管的分泌运动及吸收功能发生障碍。肠壁的炎性变化和血管破坏则使大量的液体和血液流入肠管内。这时病鸡表现为消瘦、肌肉苍白、贫血和排胡萝卜样血便等症状。同时上皮细胞崩解后所产生的有毒物质蓄积在肠管中引起机体中毒，表现为精神沉郁、昏迷、翅下垂。肠粘膜损伤后为病原微生物和肠道有毒物质侵入打开了门户，导致各种继发性感染。
    肉鸡球虫病根据发病症状和流行病学即可确诊，治疗时应结合改善环境（包括饲养密度、湿度通风和卫生条件等）增加饲料维生素含量和饲料营养配比、辅助药物治疗。