在对抗传染性疾病时，第一步是正确地识别致病原，以及在宿主上引起的症状和损伤。

一个正确的诊断会影响现有的治疗效果，特别是如果采用预防措施如接种疫苗。

传统的技术如显微镜观察和卵囊计数都是非常有用的筛选方法，且有助于动物上球虫病的诊断和治疗。

但是，DNA为基础的方法克服了传统方法的一些限制，能在短时间内测定更多的样本，灵敏度增加，而且能一步定量寄生虫。