畜禽粪便污染已成为农村面源污染的主要根源，在不影响畜产品产量和质量的前提下，如何降低畜牧业污染，提高畜产品的安全性已成为人们关注的焦点，同时也是研究的热点。　
　　导致畜牧业污染的根源在于饲料，因此，推行和使用安全、高效的环保生态型饲料，对减轻畜产品公害和环境污染具有积极意义。　
　　环保生态型饲料应具备以下条件：无臭味，无污染，消化吸收好，饲料利用率高；畜禽生产性能和繁殖性能好，疾病少，氮、磷及重金属元素排放少；畜产品安全、卫生、优质。因此，环保生态型饲料的生产必须在原料的选购、配方设计和加工饲喂等方面进行严格的质量控制。　
　　原料的选择。应按照生产绿色畜产品和有机食品的要求，选择无农药、无“三废”污染、抗营养因子少的安全、优质、可靠的饲料原料，有条件的可进行农药、重金属等饲料卫生指标的检测。原料要采购方便，不能经常变动，还要容易消化吸收，因为消化率高可降低粪便中氮的排出量。　
　　按照饲养标准设计配方。根据不同品种、不同生理阶段、环境、日粮类型设计相应的营养水平，并充分考虑饲料原料因产地、品种、加工、储存等因素影响后的养分含量及生物学效价，避免营养浪费或不足。　
　　控制氮的排泄。采用“理想蛋白质模式”，从氨基酸平衡着手，在畜禽日粮中使用合成氨基酸或寡肽，能够降低日粮的蛋白质水平2个百分点或更多，提高日粮中氮的利用率，减少粪尿中氮的排泄量20%～50%，粪尿中的臭味物质显著减少。日粮中蛋白质水平每下降1个百分点，粪尿氨气的释放量就下降10%～12.5%。　
　　控制磷的排泄。畜禽饲料中大部分的磷属于有机态的植酸磷，它不仅难被动物利用，而且大部分又经畜禽粪尿排泄而导致严重的环境污染。日粮中添加植酸酶能使磷的利用率提高50%～80%，降低粪便中总磷含量25%～50%，同时还能提高钙、镁、铜、锌的吸收率和沉积率。　
　　使用有机微量元素。目前我国矿物质微量元素添加剂的使用多数还是无机盐类，其在动物体内的利用率低，但许多人从成本上考虑，使其添加量不断增加。有机微量元素与无机盐相比，微量元素以螯合物的形式添加到饲料中，可以提高其生物利用率。目前，以蛋氨酸锌、蛋氨酸锰、赖氨酸铜等对动物的效果最好。　 
　　添加除臭剂。在日粮中添加活性碳、沙皂素等除臭剂，能明显减少粪中的氨气及硫化氢等臭气的产生，减少粪中的氨气量40%～50%。丝兰属植物提取物、天然沸石为主的硅酸盐矿石、绿矾、微胶化微生物和酶制剂等，可以吸附，抑制，分解，转化畜禽排泄物中的有毒有害物质，从而减轻或消除臭味污染。　
　　改进加工工艺。诸如粉碎，混合，制粒以及膨化等饲料加工工艺的改进，有助于改善饲料的适口性，提高畜禽对养分的利用率，减少饲料的浪费，减轻对环境的污染和降低成本。饲料膨化和颗粒化处理还可以破坏或抑制饲料中的抗营养因子、有毒有害物质和微生物，改善饲料的卫生，提高养分的消化吸收率，使粪便排出的干物质减少1/3。
    抗生素替代品的应用。长期以来，抗生素作为生长促进剂应用于畜牧业生产取得了良好的效果。但由于其耐药性、畜产品残留、过敏中毒反应及“三致”作用等危害日益严重，因此，在畜牧业生产中禁用抗生素已是大势所趋。目前用于替代抗生素的添加剂主要有以下几种：酶制剂、微生态制剂、中草药、酸化剂、寡聚糖、甜菜碱、糖萜剂和生物肽添加剂等。